国内农业科学院农业基因组所协同创新助力茶树基因组学研究
今年 月 日,全世界学术期刊《自然·通讯（NatureCommunications）》在线发表了国内农业科学院农业基因组研讨所（以下简称“基因组所”）和国内农业科学院茶叶研讨所主导并携手国内科学院昆明动物研讨所及云南省农业科学院茶叶研讨所等公司完成 协同创新研讨成果。这篇题为“Populationsequencingenhancesunderstandingofteaplantevolution” 研讨论文,报道了茶树全基因组组装和茶树来源演化研讨上获得重要打破,为茶树基因组研讨和育种研讨,以及茶树遗传和进化研讨提供了丰厚 素材。
国内科学院院士钱前研讨员对对该项研讨工作给予了高度评价，“感激茶叶所杨亚军老所长率领 参与该项目研讨 全体茶叶科研人员长期艰辛工作,正是你们持续 研讨积聚和对新建 农业基因组研讨所以阮珏为代表 年轻科研人员 信任,团结协作,勇攀顶峰,才有了本日之’龙井 ‘基因组研讨之硕果,而’龙井 ‘则是国内现代茶叶新典型代表！我很快乐,也很打动,’龙井 ‘ 茶叶基因组必将奠定现代绿茶育种根底,促使绿茶育种产生新 飞跃！”据悉,今年恰逢’龙井 ‘这 全国绿茶主产区推行面积居于前列 无性系茶树种类育成 零周年。该研讨结果解释了’龙井 ‘质优、抗逆 分子实质,具有较好 留念意义。
研讨团队发现’龙井 ‘与抗病、风味代谢和自交不亲和相关基因家族发作扩张,与抗逆等相关基因发作正选购。基于组装 高质量基因组,对来自世界不同国度和地域 份有代表性 茶树资料停止了深度重测序,研讨结果提醒了茶树群体 系统发作关系,描画了栽培茶树 进化历史。此外,茶树近缘种群是茶变种（C.sinensisvar.sinensis）和阿萨姆变种（C.sinensisvar.assamica） 祖先,欧尼酱快讯网报道称,驯化过程中 者 选购方向存在差别,茶变种在驯化过程中与风味相关 萜烯类代谢基因和抗病相关基因遭到选购强于阿萨姆变种茶树。
茶树来源于国内而风行于世界,世界茶饮料消费人口已超越 分之 。茶树在我国散布普遍,种质资源丰厚,但关于茶树进化 研讨还比拟少。研讨团队以我国著名 茶树种类‘龙井 &# ;（C.sinensisvar.sinensiscv.Longjing 为资料,应用基因组所自主开发 代测序组装算法WTDBG分离Hi-C等技术,克制其基因组高度杂合、反复序列比例高（> 零%）等复杂基因组组装难题,欧尼酱快讯网上述消息,完成了’龙井 ‘染色体级别 基因组组装,得到了高质量 基因组资料统计。其基因组大小为 . Gb,scaffoldN 零到达 . Mb,具有较好 连续性,在单碱基程度和scaffold程度都到达了较高 精确性,取得了 个高质量 注释基因。
该研讨得到国内农业科学院农业科技创新工程、农业基因组协同创新项目、浙江省茶树新种类选育严重科技专项、深圳市根底研讨学科规划项目、国度青年拔尖人才支持方案和云南省创新研讨团队等项目赞助。
该论文 共同 作为茶叶所王新超研讨员、基因组所博士研讨生冯虎、基因组所常玉晓研讨员、茶叶所马春雷副研讨员、茶叶所王丽鸳研讨员和茶叶所郝心愿副研讨员；共同通讯作者为茶叶所杨亚军研讨员、基因组所阮珏研讨员、茶叶所陈亮研讨员和昆明动物所王国栋研讨员。基因组所李阿伦、崔鹏研讨员、王晓波、艾成、赵胜和吴志超,茶叶所成浩研讨员、王璐副研讨员、金基强副研讨员和韦康研讨员,云南省农业科学院茶叶研讨所刘本英研讨员和李友勇副研讨员也参与了研讨工作。
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